辽宁省疾病预防控制中心中心内设职能科室10个、专业所16个和服务科室3个。包括：职能科室：行政办公室、业务办公室、质量管理科、人事科、财务科、产业管理办公室、党委工会办公室、离退休职工服务科、安全保卫科、学会办公室；专业所：传染与感染性疾病控制所、艾滋病与性传播疾病控制所、结核病防治所、地方病防治所、免疫规划所、病媒生物控制所、消毒监测所、社会医学与健康研究所、环境与职业卫生所、放射卫生防护所、营养食品安全与学校卫生监测所、农村环境卫生监测所、理化技术检测所、卫生微生物检测所、毒理技术检测所、*公共卫生杂志社；服务科室：新技术开发科（安迪高科技公司）、辽源核技术公司、免疫门诊部。仪器与设备主要职责中心仪器设备原价值约3500万元，拥有10万元以上仪器设备110余件，其中包括：传染与感染性疾病控制所：DNA序列分析仪、PCR扩增仪、凝胶成像分析系统、真空冷冻干燥机、超低温冰箱；理化技术检测所：液相色谱仪、气质联用仪、电感耦合等离子体-质谱联用仪、原子吸收分光光度计、高效毛细管电泳仪、高压密闭微波化学工作站、全自动定氨仪；毒理技术检测所：全自动病理切片系统、全自动显微图像分析系统、全自动染片仪、高级自动组织脱水机、染色体图像分析系统、血细胞分析仪、生化分析仪；放射卫生防护所：低本底α、β测量仪、微机多道r能谱仪、Nal便携式多道分析仪、医用X线QC检测仪、CT、MRI多功能质量体膜、中子计量仪、氡测量仪、医用X线多功能检测系统、x、γ射线巡测仪、α、β表面污染仪；环境与职业卫生所：便携式红外线光谱气体分析仪、电磁场测量系统、VOC检测仪、声学振动分析仪。辽宁省疾病预防控制中心的主要职能是疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、技术管理与应用研究指导。具体职责如下：完成国家下达的重大疾病预防控制的指令性任务，组织实施本省疾病预防控制规划、方案，对重大疾病流行趋势进行监测与预测预警。实施辖区免疫规划方案与计划，负责预防性生物制品使用管理；开展疫苗使用效果评价，参与重大免疫接种异常反应及事故处置。组建应急处理队伍，指导和开展重大突发公共卫生事件调查与处置。开展病原微生物检验检测及毒物与污染物的检验鉴定和毒理学检验，负责辖区内疾病预防控制实验室质量控制。建设省级网络信息平台，管理全省疫情及相关公共卫生信息网络。组织开展公共卫生健康危害因素监测，开展卫生学评价和干预；按照国家统一部署，组织开展食品卫生、环境卫生等领域危险性评价、监测和预警工作。承担卫生行政部门委托的卫生监督检验及技术仲裁工作，承担客户健康相关产品检验委托。指导开展疾病预防及公共卫生领域相关健康教育与健康促进工作。开展对地市(县、区)级疾病预防控制机构的业务指导和人员培训；组织实施地市(县、区)级疾病预防控制机构业务考核；规范指导辖区内医疗卫生机构传染病防治工作。参与开展疾病预防控制应用性科学研究，推广先进技术；参与拟订国家疾病预防及公共卫生相关法规、标准。承担省卫生厅交付的其它任务。实验室荣誉中心现有实验室用房12000平方米，约占业务办公用房的50%。其中生物安全P3实验室设有3个中级操作间，设计标准功能齐备；传染与感染性疾病控制所的P2实验室可进行各种二级病原微生物实验和研究；保健食品功效实验室、脊灰实验室、艾滋病检测确认实验室、结核病参比实验室、碘缺乏病实验室均通过了国家卫生部的认证或认可。农药、杀虫剂药效试验实验室通过了国家农业部认可。毒理学实验室检测水平处于国内领先地位，可进行各项食品、保健品及药物的毒理学毒性鉴定和功能学效果评价。环境与职业卫生所、放射卫生防护所分别获得了建设项目职业病危害评价和职业危害因素检测与评价甲级资质及放射建设项目危害评价和放射危害因素检测与评价甲级资质。2004年11月23日辽宁省疾病预防控制中心顺利通过了*实验室认可委员会和国家计量认证卫生行业评审组“二合一”联合评审，根本上提高了中心的检测技术水平、管理水平和综合服务能力。我们通过的“二合一”评审项目是全国省级CDC中数量最多的，也正因如此，我们具备了在全省乃至全国检验市场上的竞争力。2001年国家卫生部授予“全国消灭脊髓灰质炎工作先进集体”、“全国结核病防治工作先进集体”；2002年国家卫生部、教育部授予“全国学生常见病综合防治工作先进集体”、省卫生厅授予“辽宁省卫生系统形象工程先进单位”；2003年国家卫生部、人事部授予“全国卫生系统抗击非典先进集体”、中共辽宁省委授予“先进党委”；2004年国家卫生部授予“卫生部首届医药卫生优秀期刊一等奖”、省卫生厅授予“全省卫生系统优秀服务标兵单位”，省档案局授予“省二级档案管理先进单位”；2005年省政府授予“抗洪救灾先进集体”、省卫生厅授予“厅直单位目标考核先进单位”及“省卫生系统‘诚信服务杯’竞赛标兵单位”。人才与科研培训中心编制437人,在职职工416人,其中博士6人,硕士26人,具有正高级技术职称资格62人,副高级技术职称资格100人，中级技术职称资格115人，在职人员中有3人是享受“国务院政府特殊津贴”的专家。2000～2005年获科研成果8项，省、部级科技进步一等奖1项、二等奖11项、三等奖10项。